本書共分四個部分：早期的乙酉夏南歸赴試日記和庚戌赴西陵日記，以翁同龢原手稿復印件為底本整理；作為日記主體的咸豊八年至光緒三十年的日記，以1925年商務印書館的手稿影印本為底本整理；軍機処日記，包括中法戦爭、甲午海戦日記，以臺灣學生書局1966年出版的手稿影印本等為底本整理；翁同和自訂年譜等，以原手稿復印件為底本整理。以保持手稿原貌為原則。附《刪改真相》。新式標點，橫排簡體字。